Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARPBPQ9NWS1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARPBPQ9NWS1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARPBPQ9NWS1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARPBPQ9NWS1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARPBPQ9NWS1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARPBPQ9NWS1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARPBPQ9NWS1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARPBPQ9NWS1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARPBPQ9NWS1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARPBPQ9NWS1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARPBPQ9NWS1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARPBPQ9NWS1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARPBPQ9NWS1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARPBPQ9NWS1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARPBPQ9NWS1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARPBPQ9NWS1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARPBPQ9NWS1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARPBPQ9NWS1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARPBPQ9NWS1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARPBPQ9NWS1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARPBPQ9NWS1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARPBPQ9NWS1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARPBPQ9NWS1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARPBPQ9NWS1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARPBPQ9NWS1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARPBPQ9NWS1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARPBPQ9NWS1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARPBPQ9NWS1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARPBPQ9NWS1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARPBPQ9NWS1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARPBPQ9NWS1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARPBPQ9NWS1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARPBPQ9NWS1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARPBPQ9NWS1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARPBPQ9NWS1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARPBPQ9NWS1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARPBPQ9NWS1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARPBPQ9NWS1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARPBPQ9NWS1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PARPBPQ9NWS1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARPBPQ9NWS1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARPBPQ9NWS1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PARPBPQ9NWS1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARPBPQ9NWS1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARPBPQ9NWS1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PARPBPQ9NWS1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARPBPQ9NWS1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PARPBPQ9NWS1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARPBPQ9NWS1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARPBPQ9NWS1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PARPBPQ9NWS1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PARPBPQ9NWS1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PARPBPQ9NWS1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PARPBPQ9NWS1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARPBPQ9NWS1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARPBPQ9NWS1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PARPBPQ9NWS1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARPBPQ9NWS1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARPBPQ9NWS1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PARPBPQ9NWS1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARPBPQ9NWS1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARPBPQ9NWS1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PARPBPQ9NWS1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARPBPQ9NWS1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms