Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCIQ9NVI1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCIQ9NVI1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCIQ9NVI1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCIQ9NVI1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCIQ9NVI1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCIQ9NVI1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FANCIQ9NVI1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FANCIQ9NVI1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCIQ9NVI1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCIQ9NVI1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FANCIQ9NVI1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCIQ9NVI1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCIQ9NVI1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCIQ9NVI1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
FANCIQ9NVI1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FANCIQ9NVI1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FANCIQ9NVI1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FANCIQ9NVI1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
FANCIQ9NVI1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
FANCIQ9NVI1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
FANCIQ9NVI1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FANCIQ9NVI1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FANCIQ9NVI1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FANCIQ9NVI1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FANCIQ9NVI1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
FANCIQ9NVI1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
FANCIQ9NVI1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FANCIQ9NVI1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
FANCIQ9NVI1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
FANCIQ9NVI1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FANCIQ9NVI1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FANCIQ9NVI1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FANCIQ9NVI1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
FANCIQ9NVI1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FANCIQ9NVI1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
FANCIQ9NVI1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FANCIQ9NVI1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FANCIQ9NVI1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FANCIQ9NVI1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FANCIQ9NVI1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
FANCIQ9NVI1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FANCIQ9NVI1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FANCIQ9NVI1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FANCIQ9NVI1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FANCIQ9NVI1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FANCIQ9NVI1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FANCIQ9NVI1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FANCIQ9NVI1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FANCIQ9NVI1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FANCIQ9NVI1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FANCIQ9NVI1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FANCIQ9NVI1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
FANCIQ9NVI1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FANCIQ9NVI1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
FANCIQ9NVI1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
FANCIQ9NVI1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FANCIQ9NVI1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FANCIQ9NVI1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FANCIQ9NVI1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FANCIQ9NVI1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FANCIQ9NVI1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FANCIQ9NVI1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
FANCIQ9NVI1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FANCIQ9NVI1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
FANCIQ9NVI1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FANCIQ9NVI1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FANCIQ9NVI1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FANCIQ9NVI1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
FANCIQ9NVI1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FANCIQ9NVI1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
FANCIQ9NVI1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
FANCIQ9NVI1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
FANCIQ9NVI1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCIQ9NVI1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
FANCIQ9NVI1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCIQ9NVI1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCIQ9NVI1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FANCIQ9NVI1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FANCIQ9NVI1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCIQ9NVI1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCIQ9NVI1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FANCIQ9NVI1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
FANCIQ9NVI1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms