Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF19Q9NS68 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF19Q9NS68 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF19Q9NS68 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF19Q9NS68 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF19Q9NS68 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF19Q9NS68 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF19Q9NS68 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF19Q9NS68 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF19Q9NS68 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF19Q9NS68 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF19Q9NS68 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF19Q9NS68 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF19Q9NS68 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF19Q9NS68 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF19Q9NS68 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF19Q9NS68 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF19Q9NS68 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF19Q9NS68 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF19Q9NS68 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF19Q9NS68 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF19Q9NS68 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF19Q9NS68 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF19Q9NS68 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF19Q9NS68 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF19Q9NS68 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF19Q9NS68 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF19Q9NS68 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF19Q9NS68 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF19Q9NS68 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF19Q9NS68 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF19Q9NS68 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF19Q9NS68 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF19Q9NS68 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF19Q9NS68 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF19Q9NS68 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF19Q9NS68 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF19Q9NS68 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF19Q9NS68 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF19Q9NS68 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF19Q9NS68 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF19Q9NS68 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF19Q9NS68 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF19Q9NS68 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF19Q9NS68 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF19Q9NS68 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF19Q9NS68 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF19Q9NS68 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF19Q9NS68 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF19Q9NS68 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF19Q9NS68 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF19Q9NS68 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF19Q9NS68 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF19Q9NS68 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF19Q9NS68 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF19Q9NS68 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF19Q9NS68 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms