Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL1Q9NR64 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL1Q9NR64 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL1Q9NR64 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL1Q9NR64 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL1Q9NR64 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KLHL1Q9NR64 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL1Q9NR64 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL1Q9NR64 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL1Q9NR64 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL1Q9NR64 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL1Q9NR64 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL1Q9NR64 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL1Q9NR64 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL1Q9NR64 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL1Q9NR64 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL1Q9NR64 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL1Q9NR64 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL1Q9NR64 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL1Q9NR64 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL1Q9NR64 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL1Q9NR64 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHL1Q9NR64 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL1Q9NR64 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL1Q9NR64 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL1Q9NR64 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL1Q9NR64 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL1Q9NR64 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL1Q9NR64 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL1Q9NR64 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL1Q9NR64 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL1Q9NR64 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL1Q9NR64 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL1Q9NR64 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHL1Q9NR64 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL1Q9NR64 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL1Q9NR64 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL1Q9NR64 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL1Q9NR64 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL1Q9NR64 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL1Q9NR64 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL1Q9NR64 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL1Q9NR64 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL1Q9NR64 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL1Q9NR64 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL1Q9NR64 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL1Q9NR64 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL1Q9NR64 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL1Q9NR64 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL1Q9NR64 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL1Q9NR64 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL1Q9NR64 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL1Q9NR64 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL1Q9NR64 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL1Q9NR64 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL1Q9NR64 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL1Q9NR64 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL1Q9NR64 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL1Q9NR64 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL1Q9NR64 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL1Q9NR64 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL1Q9NR64 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL1Q9NR64 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL1Q9NR64 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL1Q9NR64 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL1Q9NR64 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL1Q9NR64 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL1Q9NR64 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL1Q9NR64 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL1Q9NR64 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL1Q9NR64 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms