Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2K0

HERV-H_2q24.3 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2K0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9N2K0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9N2K0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9N2K0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9N2K0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9N2K0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9N2K0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9N2K0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9N2K0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9N2K0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9N2K0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9N2K0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9N2K0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9N2K0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9N2K0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9N2K0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9N2K0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9N2K0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9N2K0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9N2K0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9N2K0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9N2K0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9N2K0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9N2K0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9N2K0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9N2K0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9N2K0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9N2K0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9N2K0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9N2K0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9N2K0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9N2K0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9N2K0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9N2K0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9N2K0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9N2K0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9N2K0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9N2K0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9N2K0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9N2K0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9N2K0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9N2K0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9N2K0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9N2K0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9N2K0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9N2K0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9N2K0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9N2K0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9N2K0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9N2K0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9N2K0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9N2K0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9N2K0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9N2K0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9N2K0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9N2K0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9N2K0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9N2K0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9N2K0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9N2K0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9N2K0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9N2K0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9N2K0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9N2K0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9N2K0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9N2K0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9N2K0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9N2K0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9N2K0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9N2K0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9N2K0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9N2K0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9N2K0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9N2K0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9N2K0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9N2K0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9N2K0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9N2K0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9N2K0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9N2K0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9N2K0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9N2K0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9N2K0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9N2K0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9N2K0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9N2K0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9N2K0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9N2K0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9N2K0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9N2K0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9N2K0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9N2K0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9N2K0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9N2K0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9N2K0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9N2K0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9N2K0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9N2K0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9N2K0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9N2K0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms