Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KIAA1549Q9HCM3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KIAA1549Q9HCM3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIAA1549Q9HCM3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KIAA1549Q9HCM3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIAA1549Q9HCM3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIAA1549Q9HCM3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA1549Q9HCM3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIAA1549Q9HCM3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIAA1549Q9HCM3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA1549Q9HCM3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1549Q9HCM3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1549Q9HCM3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1549Q9HCM3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1549Q9HCM3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1549Q9HCM3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1549Q9HCM3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1549Q9HCM3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA1549Q9HCM3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA1549Q9HCM3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA1549Q9HCM3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA1549Q9HCM3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIAA1549Q9HCM3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIAA1549Q9HCM3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1549Q9HCM3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KIAA1549Q9HCM3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA1549Q9HCM3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KIAA1549Q9HCM3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIAA1549Q9HCM3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIAA1549Q9HCM3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KIAA1549Q9HCM3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIAA1549Q9HCM3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIAA1549Q9HCM3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIAA1549Q9HCM3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIAA1549Q9HCM3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIAA1549Q9HCM3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KIAA1549Q9HCM3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA1549Q9HCM3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIAA1549Q9HCM3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIAA1549Q9HCM3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIAA1549Q9HCM3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIAA1549Q9HCM3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIAA1549Q9HCM3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIAA1549Q9HCM3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA1549Q9HCM3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA1549Q9HCM3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA1549Q9HCM3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIAA1549Q9HCM3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA1549Q9HCM3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIAA1549Q9HCM3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA1549Q9HCM3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KIAA1549Q9HCM3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KIAA1549Q9HCM3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIAA1549Q9HCM3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIAA1549Q9HCM3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIAA1549Q9HCM3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KIAA1549Q9HCM3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA1549Q9HCM3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KIAA1549Q9HCM3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA1549Q9HCM3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA1549Q9HCM3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA1549Q9HCM3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KIAA1549Q9HCM3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KIAA1549Q9HCM3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KIAA1549Q9HCM3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KIAA1549Q9HCM3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIAA1549Q9HCM3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KIAA1549Q9HCM3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIAA1549Q9HCM3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIAA1549Q9HCM3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KIAA1549Q9HCM3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KIAA1549Q9HCM3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA1549Q9HCM3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA1549Q9HCM3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KIAA1549Q9HCM3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIAA1549Q9HCM3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549Q9HCM3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549Q9HCM3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIAA1549Q9HCM3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1549Q9HCM3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1549Q9HCM3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIAA1549Q9HCM3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1549Q9HCM3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1549Q9HCM3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1549Q9HCM3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1549Q9HCM3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1549Q9HCM3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1549Q9HCM3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1549Q9HCM3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1549Q9HCM3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1549Q9HCM3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1549Q9HCM3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1549Q9HCM3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1549Q9HCM3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1549Q9HCM3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIAA1549Q9HCM3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms