Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOD2Q9HC29 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NOD2Q9HC29 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOD2Q9HC29 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NOD2Q9HC29 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOD2Q9HC29 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOD2Q9HC29 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOD2Q9HC29 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOD2Q9HC29 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOD2Q9HC29 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOD2Q9HC29 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOD2Q9HC29 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOD2Q9HC29 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOD2Q9HC29 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOD2Q9HC29 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOD2Q9HC29 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOD2Q9HC29 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOD2Q9HC29 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOD2Q9HC29 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOD2Q9HC29 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOD2Q9HC29 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOD2Q9HC29 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOD2Q9HC29 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOD2Q9HC29 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOD2Q9HC29 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOD2Q9HC29 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOD2Q9HC29 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOD2Q9HC29 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOD2Q9HC29 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOD2Q9HC29 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOD2Q9HC29 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOD2Q9HC29 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOD2Q9HC29 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOD2Q9HC29 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOD2Q9HC29 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOD2Q9HC29 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOD2Q9HC29 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOD2Q9HC29 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NOD2Q9HC29 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NOD2Q9HC29 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NOD2Q9HC29 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOD2Q9HC29 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOD2Q9HC29 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOD2Q9HC29 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOD2Q9HC29 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOD2Q9HC29 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOD2Q9HC29 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD2Q9HC29 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD2Q9HC29 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD2Q9HC29 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD2Q9HC29 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD2Q9HC29 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD2Q9HC29 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NOD2Q9HC29 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NOD2Q9HC29 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOD2Q9HC29 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOD2Q9HC29 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOD2Q9HC29 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOD2Q9HC29 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOD2Q9HC29 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOD2Q9HC29 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOD2Q9HC29 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOD2Q9HC29 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOD2Q9HC29 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOD2Q9HC29 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOD2Q9HC29 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOD2Q9HC29 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOD2Q9HC29 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOD2Q9HC29 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOD2Q9HC29 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOD2Q9HC29 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NOD2Q9HC29 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOD2Q9HC29 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NOD2Q9HC29 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOD2Q9HC29 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOD2Q9HC29 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOD2Q9HC29 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NOD2Q9HC29 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOD2Q9HC29 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOD2Q9HC29 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms