Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC13A1Q9BZW2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC13A1Q9BZW2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC13A1Q9BZW2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC13A1Q9BZW2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC13A1Q9BZW2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC13A1Q9BZW2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC13A1Q9BZW2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC13A1Q9BZW2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC13A1Q9BZW2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC13A1Q9BZW2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC13A1Q9BZW2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC13A1Q9BZW2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC13A1Q9BZW2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC13A1Q9BZW2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC13A1Q9BZW2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC13A1Q9BZW2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC13A1Q9BZW2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC13A1Q9BZW2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC13A1Q9BZW2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC13A1Q9BZW2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC13A1Q9BZW2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC13A1Q9BZW2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC13A1Q9BZW2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC13A1Q9BZW2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC13A1Q9BZW2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC13A1Q9BZW2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC13A1Q9BZW2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC13A1Q9BZW2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC13A1Q9BZW2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC13A1Q9BZW2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC13A1Q9BZW2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC13A1Q9BZW2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC13A1Q9BZW2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC13A1Q9BZW2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC13A1Q9BZW2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC13A1Q9BZW2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC13A1Q9BZW2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC13A1Q9BZW2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC13A1Q9BZW2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC13A1Q9BZW2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC13A1Q9BZW2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC13A1Q9BZW2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC13A1Q9BZW2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC13A1Q9BZW2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC13A1Q9BZW2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC13A1Q9BZW2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC13A1Q9BZW2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC13A1Q9BZW2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC13A1Q9BZW2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC13A1Q9BZW2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC13A1Q9BZW2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC13A1Q9BZW2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC13A1Q9BZW2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC13A1Q9BZW2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC13A1Q9BZW2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC13A1Q9BZW2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC13A1Q9BZW2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC13A1Q9BZW2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC13A1Q9BZW2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC13A1Q9BZW2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC13A1Q9BZW2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC13A1Q9BZW2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC13A1Q9BZW2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC13A1Q9BZW2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC13A1Q9BZW2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC13A1Q9BZW2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC13A1Q9BZW2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC13A1Q9BZW2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC13A1Q9BZW2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC13A1Q9BZW2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC13A1Q9BZW2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC13A1Q9BZW2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC13A1Q9BZW2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC13A1Q9BZW2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC13A1Q9BZW2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC13A1Q9BZW2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC13A1Q9BZW2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC13A1Q9BZW2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC13A1Q9BZW2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC13A1Q9BZW2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC13A1Q9BZW2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC13A1Q9BZW2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC13A1Q9BZW2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC13A1Q9BZW2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC13A1Q9BZW2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC13A1Q9BZW2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC13A1Q9BZW2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC13A1Q9BZW2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC13A1Q9BZW2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC13A1Q9BZW2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC13A1Q9BZW2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC13A1Q9BZW2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC13A1Q9BZW2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC13A1Q9BZW2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC13A1Q9BZW2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC13A1Q9BZW2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC13A1Q9BZW2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC13A1Q9BZW2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms