Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM54Q9BYV2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM54Q9BYV2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM54Q9BYV2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM54Q9BYV2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM54Q9BYV2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM54Q9BYV2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM54Q9BYV2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM54Q9BYV2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM54Q9BYV2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM54Q9BYV2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM54Q9BYV2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM54Q9BYV2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM54Q9BYV2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM54Q9BYV2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM54Q9BYV2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM54Q9BYV2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM54Q9BYV2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM54Q9BYV2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM54Q9BYV2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM54Q9BYV2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM54Q9BYV2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM54Q9BYV2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM54Q9BYV2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM54Q9BYV2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM54Q9BYV2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM54Q9BYV2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM54Q9BYV2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM54Q9BYV2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM54Q9BYV2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM54Q9BYV2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM54Q9BYV2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM54Q9BYV2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM54Q9BYV2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM54Q9BYV2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM54Q9BYV2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM54Q9BYV2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM54Q9BYV2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM54Q9BYV2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM54Q9BYV2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM54Q9BYV2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM54Q9BYV2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM54Q9BYV2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM54Q9BYV2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM54Q9BYV2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM54Q9BYV2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM54Q9BYV2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM54Q9BYV2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM54Q9BYV2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM54Q9BYV2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM54Q9BYV2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM54Q9BYV2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM54Q9BYV2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM54Q9BYV2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM54Q9BYV2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM54Q9BYV2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM54Q9BYV2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM54Q9BYV2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM54Q9BYV2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM54Q9BYV2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM54Q9BYV2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM54Q9BYV2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM54Q9BYV2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM54Q9BYV2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM54Q9BYV2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM54Q9BYV2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM54Q9BYV2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM54Q9BYV2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM54Q9BYV2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM54Q9BYV2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM54Q9BYV2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM54Q9BYV2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM54Q9BYV2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM54Q9BYV2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM54Q9BYV2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM54Q9BYV2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM54Q9BYV2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM54Q9BYV2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM54Q9BYV2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM54Q9BYV2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM54Q9BYV2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM54Q9BYV2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM54Q9BYV2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms