Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC17Q9BRA2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC17Q9BRA2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TXNDC17Q9BRA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC17Q9BRA2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC17Q9BRA2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC17Q9BRA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TXNDC17Q9BRA2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TXNDC17Q9BRA2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TXNDC17Q9BRA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TXNDC17Q9BRA2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TXNDC17Q9BRA2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TXNDC17Q9BRA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TXNDC17Q9BRA2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXNDC17Q9BRA2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXNDC17Q9BRA2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TXNDC17Q9BRA2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TXNDC17Q9BRA2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TXNDC17Q9BRA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC17Q9BRA2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TXNDC17Q9BRA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC17Q9BRA2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC17Q9BRA2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC17Q9BRA2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC17Q9BRA2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC17Q9BRA2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC17Q9BRA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC17Q9BRA2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC17Q9BRA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC17Q9BRA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TXNDC17Q9BRA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC17Q9BRA2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TXNDC17Q9BRA2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC17Q9BRA2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC17Q9BRA2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC17Q9BRA2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TXNDC17Q9BRA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TXNDC17Q9BRA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC17Q9BRA2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC17Q9BRA2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TXNDC17Q9BRA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TXNDC17Q9BRA2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TXNDC17Q9BRA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TXNDC17Q9BRA2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TXNDC17Q9BRA2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TXNDC17Q9BRA2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TXNDC17Q9BRA2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TXNDC17Q9BRA2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TXNDC17Q9BRA2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TXNDC17Q9BRA2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TXNDC17Q9BRA2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TXNDC17Q9BRA2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TXNDC17Q9BRA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TXNDC17Q9BRA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TXNDC17Q9BRA2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC17Q9BRA2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC17Q9BRA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TXNDC17Q9BRA2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC17Q9BRA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TXNDC17Q9BRA2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TXNDC17Q9BRA2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TXNDC17Q9BRA2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TXNDC17Q9BRA2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TXNDC17Q9BRA2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms