Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HINFPQ9BQA5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HINFPQ9BQA5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HINFPQ9BQA5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HINFPQ9BQA5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HINFPQ9BQA5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HINFPQ9BQA5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HINFPQ9BQA5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HINFPQ9BQA5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HINFPQ9BQA5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HINFPQ9BQA5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HINFPQ9BQA5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HINFPQ9BQA5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HINFPQ9BQA5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HINFPQ9BQA5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HINFPQ9BQA5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HINFPQ9BQA5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HINFPQ9BQA5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HINFPQ9BQA5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HINFPQ9BQA5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HINFPQ9BQA5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HINFPQ9BQA5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
HINFPQ9BQA5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HINFPQ9BQA5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HINFPQ9BQA5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HINFPQ9BQA5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HINFPQ9BQA5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HINFPQ9BQA5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HINFPQ9BQA5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HINFPQ9BQA5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HINFPQ9BQA5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HINFPQ9BQA5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HINFPQ9BQA5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HINFPQ9BQA5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HINFPQ9BQA5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HINFPQ9BQA5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HINFPQ9BQA5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HINFPQ9BQA5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HINFPQ9BQA5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HINFPQ9BQA5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HINFPQ9BQA5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HINFPQ9BQA5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HINFPQ9BQA5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HINFPQ9BQA5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HINFPQ9BQA5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HINFPQ9BQA5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HINFPQ9BQA5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HINFPQ9BQA5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HINFPQ9BQA5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HINFPQ9BQA5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HINFPQ9BQA5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HINFPQ9BQA5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HINFPQ9BQA5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HINFPQ9BQA5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HINFPQ9BQA5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HINFPQ9BQA5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HINFPQ9BQA5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HINFPQ9BQA5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HINFPQ9BQA5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HINFPQ9BQA5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HINFPQ9BQA5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HINFPQ9BQA5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HINFPQ9BQA5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HINFPQ9BQA5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HINFPQ9BQA5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HINFPQ9BQA5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HINFPQ9BQA5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HINFPQ9BQA5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HINFPQ9BQA5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HINFPQ9BQA5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HINFPQ9BQA5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HINFPQ9BQA5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HINFPQ9BQA5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HINFPQ9BQA5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HINFPQ9BQA5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HINFPQ9BQA5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HINFPQ9BQA5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HINFPQ9BQA5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HINFPQ9BQA5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HINFPQ9BQA5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HINFPQ9BQA5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HINFPQ9BQA5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HINFPQ9BQA5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HINFPQ9BQA5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HINFPQ9BQA5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HINFPQ9BQA5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HINFPQ9BQA5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
HINFPQ9BQA5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HINFPQ9BQA5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HINFPQ9BQA5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HINFPQ9BQA5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HINFPQ9BQA5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HINFPQ9BQA5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HINFPQ9BQA5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HINFPQ9BQA5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HINFPQ9BQA5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HINFPQ9BQA5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HINFPQ9BQA5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HINFPQ9BQA5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HINFPQ9BQA5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms