Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAPGQ9BPX3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAPGQ9BPX3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAPGQ9BPX3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPGQ9BPX3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAPGQ9BPX3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCAPGQ9BPX3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCAPGQ9BPX3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPGQ9BPX3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPGQ9BPX3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPGQ9BPX3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPGQ9BPX3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPGQ9BPX3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPGQ9BPX3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPGQ9BPX3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCAPGQ9BPX3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCAPGQ9BPX3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCAPGQ9BPX3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPGQ9BPX3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPGQ9BPX3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPGQ9BPX3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NCAPGQ9BPX3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPGQ9BPX3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPGQ9BPX3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPGQ9BPX3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPGQ9BPX3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPGQ9BPX3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCAPGQ9BPX3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPGQ9BPX3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPGQ9BPX3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCAPGQ9BPX3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCAPGQ9BPX3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NCAPGQ9BPX3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCAPGQ9BPX3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCAPGQ9BPX3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCAPGQ9BPX3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCAPGQ9BPX3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCAPGQ9BPX3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCAPGQ9BPX3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCAPGQ9BPX3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCAPGQ9BPX3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCAPGQ9BPX3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCAPGQ9BPX3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCAPGQ9BPX3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCAPGQ9BPX3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCAPGQ9BPX3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCAPGQ9BPX3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCAPGQ9BPX3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCAPGQ9BPX3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCAPGQ9BPX3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCAPGQ9BPX3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCAPGQ9BPX3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCAPGQ9BPX3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCAPGQ9BPX3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCAPGQ9BPX3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCAPGQ9BPX3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCAPGQ9BPX3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCAPGQ9BPX3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCAPGQ9BPX3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCAPGQ9BPX3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCAPGQ9BPX3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCAPGQ9BPX3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCAPGQ9BPX3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPGQ9BPX3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPGQ9BPX3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NCAPGQ9BPX3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPGQ9BPX3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPGQ9BPX3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAPGQ9BPX3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAPGQ9BPX3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAPGQ9BPX3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCAPGQ9BPX3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAPGQ9BPX3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAPGQ9BPX3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAPGQ9BPX3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPGQ9BPX3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NCAPGQ9BPX3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPGQ9BPX3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCAPGQ9BPX3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCAPGQ9BPX3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCAPGQ9BPX3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms