Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ARID3AQ99856 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARID3AQ99856 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARID3AQ99856 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ARID3AQ99856 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID3AQ99856 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID3AQ99856 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARID3AQ99856 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ARID3AQ99856 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARID3AQ99856 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARID3AQ99856 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARID3AQ99856 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARID3AQ99856 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARID3AQ99856 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARID3AQ99856 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ARID3AQ99856 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARID3AQ99856 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARID3AQ99856 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3AQ99856 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID3AQ99856 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms