Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NODALQ96S42 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NODALQ96S42 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NODALQ96S42 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NODALQ96S42 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NODALQ96S42 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NODALQ96S42 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NODALQ96S42 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NODALQ96S42 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NODALQ96S42 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NODALQ96S42 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NODALQ96S42 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NODALQ96S42 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NODALQ96S42 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NODALQ96S42 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NODALQ96S42 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NODALQ96S42 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NODALQ96S42 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NODALQ96S42 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NODALQ96S42 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NODALQ96S42 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NODALQ96S42 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NODALQ96S42 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NODALQ96S42 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NODALQ96S42 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NODALQ96S42 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NODALQ96S42 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NODALQ96S42 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NODALQ96S42 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NODALQ96S42 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NODALQ96S42 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NODALQ96S42 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NODALQ96S42 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NODALQ96S42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NODALQ96S42 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NODALQ96S42 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NODALQ96S42 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NODALQ96S42 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NODALQ96S42 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NODALQ96S42 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NODALQ96S42 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NODALQ96S42 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NODALQ96S42 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NODALQ96S42 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NODALQ96S42 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NODALQ96S42 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NODALQ96S42 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NODALQ96S42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NODALQ96S42 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NODALQ96S42 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NODALQ96S42 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NODALQ96S42 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NODALQ96S42 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NODALQ96S42 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NODALQ96S42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NODALQ96S42 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NODALQ96S42 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NODALQ96S42 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NODALQ96S42 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NODALQ96S42 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NODALQ96S42 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NODALQ96S42 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NODALQ96S42 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NODALQ96S42 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NODALQ96S42 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NODALQ96S42 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NODALQ96S42 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NODALQ96S42 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NODALQ96S42 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NODALQ96S42 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NODALQ96S42 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NODALQ96S42 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NODALQ96S42 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NODALQ96S42 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NODALQ96S42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NODALQ96S42 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NODALQ96S42 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NODALQ96S42 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NODALQ96S42 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NODALQ96S42 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NODALQ96S42 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NODALQ96S42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NODALQ96S42 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NODALQ96S42 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NODALQ96S42 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NODALQ96S42 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NODALQ96S42 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NODALQ96S42 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NODALQ96S42 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NODALQ96S42 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NODALQ96S42 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NODALQ96S42 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NODALQ96S42 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NODALQ96S42 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NODALQ96S42 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NODALQ96S42 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NODALQ96S42 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NODALQ96S42 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NODALQ96S42 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms