Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBGCP5Q96RT8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBGCP5Q96RT8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBGCP5Q96RT8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBGCP5Q96RT8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBGCP5Q96RT8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBGCP5Q96RT8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBGCP5Q96RT8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBGCP5Q96RT8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBGCP5Q96RT8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBGCP5Q96RT8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TUBGCP5Q96RT8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBGCP5Q96RT8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBGCP5Q96RT8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBGCP5Q96RT8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBGCP5Q96RT8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBGCP5Q96RT8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBGCP5Q96RT8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBGCP5Q96RT8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBGCP5Q96RT8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBGCP5Q96RT8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBGCP5Q96RT8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP5Q96RT8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP5Q96RT8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP5Q96RT8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP5Q96RT8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBGCP5Q96RT8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBGCP5Q96RT8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBGCP5Q96RT8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBGCP5Q96RT8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TUBGCP5Q96RT8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBGCP5Q96RT8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBGCP5Q96RT8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBGCP5Q96RT8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBGCP5Q96RT8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TUBGCP5Q96RT8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBGCP5Q96RT8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBGCP5Q96RT8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBGCP5Q96RT8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBGCP5Q96RT8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBGCP5Q96RT8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBGCP5Q96RT8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBGCP5Q96RT8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBGCP5Q96RT8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBGCP5Q96RT8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBGCP5Q96RT8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBGCP5Q96RT8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBGCP5Q96RT8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBGCP5Q96RT8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBGCP5Q96RT8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBGCP5Q96RT8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBGCP5Q96RT8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBGCP5Q96RT8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBGCP5Q96RT8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBGCP5Q96RT8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBGCP5Q96RT8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBGCP5Q96RT8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBGCP5Q96RT8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBGCP5Q96RT8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBGCP5Q96RT8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBGCP5Q96RT8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBGCP5Q96RT8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TUBGCP5Q96RT8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBGCP5Q96RT8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBGCP5Q96RT8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBGCP5Q96RT8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBGCP5Q96RT8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBGCP5Q96RT8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBGCP5Q96RT8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBGCP5Q96RT8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBGCP5Q96RT8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBGCP5Q96RT8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBGCP5Q96RT8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBGCP5Q96RT8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBGCP5Q96RT8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUBGCP5Q96RT8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBGCP5Q96RT8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms