Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ6

ZFP3, Zinc finger protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP3Q96NJ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFP3Q96NJ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFP3Q96NJ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFP3Q96NJ6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFP3Q96NJ6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFP3Q96NJ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFP3Q96NJ6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFP3Q96NJ6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZFP3Q96NJ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZFP3Q96NJ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZFP3Q96NJ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFP3Q96NJ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFP3Q96NJ6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFP3Q96NJ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFP3Q96NJ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFP3Q96NJ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFP3Q96NJ6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZFP3Q96NJ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFP3Q96NJ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFP3Q96NJ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFP3Q96NJ6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFP3Q96NJ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFP3Q96NJ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFP3Q96NJ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFP3Q96NJ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFP3Q96NJ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFP3Q96NJ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFP3Q96NJ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFP3Q96NJ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP3Q96NJ6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP3Q96NJ6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFP3Q96NJ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFP3Q96NJ6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFP3Q96NJ6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFP3Q96NJ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFP3Q96NJ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFP3Q96NJ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFP3Q96NJ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFP3Q96NJ6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFP3Q96NJ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZFP3Q96NJ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZFP3Q96NJ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZFP3Q96NJ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZFP3Q96NJ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZFP3Q96NJ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZFP3Q96NJ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFP3Q96NJ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFP3Q96NJ6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFP3Q96NJ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFP3Q96NJ6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFP3Q96NJ6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP3Q96NJ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP3Q96NJ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZFP3Q96NJ6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFP3Q96NJ6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZFP3Q96NJ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFP3Q96NJ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZFP3Q96NJ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFP3Q96NJ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZFP3Q96NJ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZFP3Q96NJ6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFP3Q96NJ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFP3Q96NJ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFP3Q96NJ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFP3Q96NJ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFP3Q96NJ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFP3Q96NJ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFP3Q96NJ6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFP3Q96NJ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFP3Q96NJ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZFP3Q96NJ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZFP3Q96NJ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFP3Q96NJ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFP3Q96NJ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZFP3Q96NJ6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFP3Q96NJ6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFP3Q96NJ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFP3Q96NJ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFP3Q96NJ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFP3Q96NJ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZFP3Q96NJ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZFP3Q96NJ6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZFP3Q96NJ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms