Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
USP47Q96K76 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
USP47Q96K76 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
USP47Q96K76 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
USP47Q96K76 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
USP47Q96K76 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
USP47Q96K76 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
USP47Q96K76 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
USP47Q96K76 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
USP47Q96K76 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
USP47Q96K76 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
USP47Q96K76 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
USP47Q96K76 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
USP47Q96K76 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
USP47Q96K76 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
USP47Q96K76 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
USP47Q96K76 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.14■■■■□ 3.86
USP47Q96K76 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
USP47Q96K76 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
USP47Q96K76 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
USP47Q96K76 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
USP47Q96K76 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
USP47Q96K76 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
USP47Q96K76 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
USP47Q96K76 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
USP47Q96K76 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
USP47Q96K76 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
USP47Q96K76 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
USP47Q96K76 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
USP47Q96K76 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
USP47Q96K76 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
USP47Q96K76 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
USP47Q96K76 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
USP47Q96K76 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
USP47Q96K76 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
USP47Q96K76 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
USP47Q96K76 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
USP47Q96K76 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
USP47Q96K76 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
USP47Q96K76 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
USP47Q96K76 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
USP47Q96K76 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
USP47Q96K76 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
USP47Q96K76 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
USP47Q96K76 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
USP47Q96K76 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
USP47Q96K76 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
USP47Q96K76 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
USP47Q96K76 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
USP47Q96K76 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
USP47Q96K76 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
USP47Q96K76 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
USP47Q96K76 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
USP47Q96K76 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
USP47Q96K76 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
USP47Q96K76 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
USP47Q96K76 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
USP47Q96K76 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
USP47Q96K76 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
USP47Q96K76 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
USP47Q96K76 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
USP47Q96K76 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
USP47Q96K76 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
USP47Q96K76 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.78
USP47Q96K76 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
USP47Q96K76 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
USP47Q96K76 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
USP47Q96K76 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
USP47Q96K76 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
USP47Q96K76 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
USP47Q96K76 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
USP47Q96K76 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
USP47Q96K76 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
USP47Q96K76 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
USP47Q96K76 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
USP47Q96K76 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
USP47Q96K76 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
USP47Q96K76 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
USP47Q96K76 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
USP47Q96K76 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
USP47Q96K76 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
USP47Q96K76 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
USP47Q96K76 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
USP47Q96K76 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
USP47Q96K76 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
USP47Q96K76 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
USP47Q96K76 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
USP47Q96K76 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
USP47Q96K76 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
USP47Q96K76 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
USP47Q96K76 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
USP47Q96K76 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms