Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC22AQ96IW7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC22AQ96IW7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC22AQ96IW7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC22AQ96IW7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC22AQ96IW7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC22AQ96IW7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC22AQ96IW7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC22AQ96IW7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC22AQ96IW7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC22AQ96IW7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC22AQ96IW7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC22AQ96IW7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC22AQ96IW7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC22AQ96IW7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC22AQ96IW7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC22AQ96IW7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC22AQ96IW7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC22AQ96IW7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC22AQ96IW7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC22AQ96IW7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22AQ96IW7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22AQ96IW7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22AQ96IW7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22AQ96IW7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22AQ96IW7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22AQ96IW7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC22AQ96IW7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC22AQ96IW7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC22AQ96IW7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC22AQ96IW7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC22AQ96IW7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC22AQ96IW7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC22AQ96IW7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC22AQ96IW7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC22AQ96IW7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC22AQ96IW7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22AQ96IW7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22AQ96IW7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC22AQ96IW7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC22AQ96IW7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC22AQ96IW7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC22AQ96IW7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22AQ96IW7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22AQ96IW7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22AQ96IW7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC22AQ96IW7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC22AQ96IW7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC22AQ96IW7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22AQ96IW7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22AQ96IW7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22AQ96IW7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC22AQ96IW7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC22AQ96IW7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms