Protein–RNA interactions for Protein: Q96I51

RCC1L, RCC1-like G exchanging factor-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1LQ96I51 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCC1LQ96I51 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCC1LQ96I51 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCC1LQ96I51 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCC1LQ96I51 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCC1LQ96I51 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCC1LQ96I51 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCC1LQ96I51 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCC1LQ96I51 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCC1LQ96I51 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCC1LQ96I51 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RCC1LQ96I51 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCC1LQ96I51 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCC1LQ96I51 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCC1LQ96I51 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCC1LQ96I51 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCC1LQ96I51 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCC1LQ96I51 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCC1LQ96I51 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCC1LQ96I51 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCC1LQ96I51 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCC1LQ96I51 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCC1LQ96I51 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCC1LQ96I51 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCC1LQ96I51 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCC1LQ96I51 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RCC1LQ96I51 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCC1LQ96I51 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCC1LQ96I51 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RCC1LQ96I51 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCC1LQ96I51 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCC1LQ96I51 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RCC1LQ96I51 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RCC1LQ96I51 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RCC1LQ96I51 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RCC1LQ96I51 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCC1LQ96I51 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RCC1LQ96I51 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCC1LQ96I51 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCC1LQ96I51 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RCC1LQ96I51 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC1LQ96I51 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCC1LQ96I51 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCC1LQ96I51 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCC1LQ96I51 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCC1LQ96I51 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCC1LQ96I51 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCC1LQ96I51 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCC1LQ96I51 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCC1LQ96I51 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCC1LQ96I51 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCC1LQ96I51 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCC1LQ96I51 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RCC1LQ96I51 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCC1LQ96I51 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCC1LQ96I51 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms