Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP6Q96FZ7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP6Q96FZ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP6Q96FZ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP6Q96FZ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP6Q96FZ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP6Q96FZ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP6Q96FZ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP6Q96FZ7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP6Q96FZ7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP6Q96FZ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP6Q96FZ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP6Q96FZ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP6Q96FZ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP6Q96FZ7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP6Q96FZ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP6Q96FZ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP6Q96FZ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP6Q96FZ7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP6Q96FZ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP6Q96FZ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP6Q96FZ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP6Q96FZ7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP6Q96FZ7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP6Q96FZ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP6Q96FZ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP6Q96FZ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP6Q96FZ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHMP6Q96FZ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP6Q96FZ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHMP6Q96FZ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHMP6Q96FZ7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP6Q96FZ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHMP6Q96FZ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHMP6Q96FZ7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHMP6Q96FZ7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHMP6Q96FZ7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP6Q96FZ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP6Q96FZ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHMP6Q96FZ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHMP6Q96FZ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP6Q96FZ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHMP6Q96FZ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP6Q96FZ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP6Q96FZ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP6Q96FZ7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP6Q96FZ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP6Q96FZ7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP6Q96FZ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP6Q96FZ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP6Q96FZ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP6Q96FZ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP6Q96FZ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP6Q96FZ7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP6Q96FZ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP6Q96FZ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP6Q96FZ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP6Q96FZ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP6Q96FZ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHMP6Q96FZ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHMP6Q96FZ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHMP6Q96FZ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHMP6Q96FZ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHMP6Q96FZ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHMP6Q96FZ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHMP6Q96FZ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHMP6Q96FZ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMP6Q96FZ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHMP6Q96FZ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP6Q96FZ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP6Q96FZ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHMP6Q96FZ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMP6Q96FZ7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHMP6Q96FZ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHMP6Q96FZ7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHMP6Q96FZ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP6Q96FZ7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP6Q96FZ7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CHMP6Q96FZ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP6Q96FZ7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP6Q96FZ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP6Q96FZ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHMP6Q96FZ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHMP6Q96FZ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms