Protein–RNA interactions for Protein: Q96A11

GAL3ST3, Galactose-3-O-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST3Q96A11 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GAL3ST3Q96A11 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GAL3ST3Q96A11 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GAL3ST3Q96A11 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GAL3ST3Q96A11 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GAL3ST3Q96A11 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GAL3ST3Q96A11 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GAL3ST3Q96A11 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GAL3ST3Q96A11 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GAL3ST3Q96A11 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GAL3ST3Q96A11 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GAL3ST3Q96A11 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GAL3ST3Q96A11 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GAL3ST3Q96A11 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GAL3ST3Q96A11 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GAL3ST3Q96A11 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GAL3ST3Q96A11 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GAL3ST3Q96A11 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GAL3ST3Q96A11 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GAL3ST3Q96A11 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GAL3ST3Q96A11 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GAL3ST3Q96A11 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GAL3ST3Q96A11 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GAL3ST3Q96A11 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAL3ST3Q96A11 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAL3ST3Q96A11 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GAL3ST3Q96A11 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAL3ST3Q96A11 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GAL3ST3Q96A11 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GAL3ST3Q96A11 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAL3ST3Q96A11 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GAL3ST3Q96A11 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GAL3ST3Q96A11 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAL3ST3Q96A11 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GAL3ST3Q96A11 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAL3ST3Q96A11 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAL3ST3Q96A11 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GAL3ST3Q96A11 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GAL3ST3Q96A11 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GAL3ST3Q96A11 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GAL3ST3Q96A11 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAL3ST3Q96A11 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GAL3ST3Q96A11 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GAL3ST3Q96A11 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GAL3ST3Q96A11 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GAL3ST3Q96A11 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GAL3ST3Q96A11 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GAL3ST3Q96A11 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GAL3ST3Q96A11 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GAL3ST3Q96A11 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GAL3ST3Q96A11 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAL3ST3Q96A11 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAL3ST3Q96A11 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAL3ST3Q96A11 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAL3ST3Q96A11 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GAL3ST3Q96A11 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GAL3ST3Q96A11 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GAL3ST3Q96A11 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GAL3ST3Q96A11 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GAL3ST3Q96A11 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAL3ST3Q96A11 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GAL3ST3Q96A11 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GAL3ST3Q96A11 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAL3ST3Q96A11 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAL3ST3Q96A11 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GAL3ST3Q96A11 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms