Protein–RNA interactions for Protein: Q969M3

YIPF5, Protein YIPF5, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF5Q969M3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF5Q969M3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF5Q969M3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YIPF5Q969M3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YIPF5Q969M3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF5Q969M3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YIPF5Q969M3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
YIPF5Q969M3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
YIPF5Q969M3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF5Q969M3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
YIPF5Q969M3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
YIPF5Q969M3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YIPF5Q969M3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF5Q969M3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YIPF5Q969M3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YIPF5Q969M3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF5Q969M3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YIPF5Q969M3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YIPF5Q969M3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YIPF5Q969M3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF5Q969M3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF5Q969M3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YIPF5Q969M3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF5Q969M3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YIPF5Q969M3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF5Q969M3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YIPF5Q969M3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF5Q969M3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF5Q969M3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YIPF5Q969M3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF5Q969M3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YIPF5Q969M3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF5Q969M3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF5Q969M3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF5Q969M3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YIPF5Q969M3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YIPF5Q969M3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YIPF5Q969M3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF5Q969M3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YIPF5Q969M3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF5Q969M3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF5Q969M3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YIPF5Q969M3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF5Q969M3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
YIPF5Q969M3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF5Q969M3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YIPF5Q969M3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF5Q969M3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YIPF5Q969M3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YIPF5Q969M3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF5Q969M3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF5Q969M3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF5Q969M3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF5Q969M3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF5Q969M3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF5Q969M3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF5Q969M3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF5Q969M3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF5Q969M3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF5Q969M3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF5Q969M3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF5Q969M3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF5Q969M3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF5Q969M3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF5Q969M3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF5Q969M3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF5Q969M3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF5Q969M3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF5Q969M3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF5Q969M3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF5Q969M3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF5Q969M3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF5Q969M3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF5Q969M3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF5Q969M3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF5Q969M3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF5Q969M3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF5Q969M3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIPF5Q969M3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YIPF5Q969M3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms