Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX1Q92499 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX1Q92499 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX1Q92499 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX1Q92499 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX1Q92499 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX1Q92499 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
DDX1Q92499 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDX1Q92499 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX1Q92499 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX1Q92499 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX1Q92499 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX1Q92499 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX1Q92499 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX1Q92499 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX1Q92499 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX1Q92499 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX1Q92499 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX1Q92499 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX1Q92499 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX1Q92499 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX1Q92499 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDX1Q92499 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDX1Q92499 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX1Q92499 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDX1Q92499 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDX1Q92499 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX1Q92499 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX1Q92499 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDX1Q92499 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX1Q92499 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX1Q92499 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX1Q92499 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX1Q92499 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX1Q92499 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX1Q92499 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX1Q92499 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX1Q92499 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX1Q92499 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX1Q92499 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX1Q92499 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX1Q92499 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX1Q92499 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX1Q92499 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX1Q92499 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX1Q92499 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX1Q92499 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX1Q92499 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX1Q92499 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX1Q92499 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX1Q92499 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX1Q92499 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX1Q92499 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX1Q92499 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX1Q92499 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX1Q92499 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX1Q92499 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX1Q92499 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX1Q92499 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX1Q92499 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX1Q92499 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX1Q92499 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX1Q92499 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX1Q92499 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX1Q92499 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX1Q92499 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX1Q92499 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX1Q92499 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX1Q92499 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms