Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF01

PNISR, Arginine/serine-rich protein PNISR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNISRQ8TF01 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PNISRQ8TF01 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PNISRQ8TF01 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PNISRQ8TF01 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PNISRQ8TF01 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PNISRQ8TF01 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PNISRQ8TF01 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PNISRQ8TF01 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PNISRQ8TF01 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PNISRQ8TF01 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PNISRQ8TF01 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PNISRQ8TF01 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PNISRQ8TF01 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PNISRQ8TF01 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PNISRQ8TF01 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PNISRQ8TF01 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PNISRQ8TF01 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PNISRQ8TF01 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PNISRQ8TF01 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PNISRQ8TF01 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PNISRQ8TF01 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PNISRQ8TF01 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.58
PNISRQ8TF01 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PNISRQ8TF01 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PNISRQ8TF01 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PNISRQ8TF01 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PNISRQ8TF01 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PNISRQ8TF01 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PNISRQ8TF01 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PNISRQ8TF01 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PNISRQ8TF01 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PNISRQ8TF01 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PNISRQ8TF01 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PNISRQ8TF01 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PNISRQ8TF01 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PNISRQ8TF01 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PNISRQ8TF01 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PNISRQ8TF01 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PNISRQ8TF01 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PNISRQ8TF01 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PNISRQ8TF01 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PNISRQ8TF01 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PNISRQ8TF01 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PNISRQ8TF01 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
PNISRQ8TF01 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PNISRQ8TF01 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PNISRQ8TF01 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PNISRQ8TF01 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
PNISRQ8TF01 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PNISRQ8TF01 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PNISRQ8TF01 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PNISRQ8TF01 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PNISRQ8TF01 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PNISRQ8TF01 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PNISRQ8TF01 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PNISRQ8TF01 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PNISRQ8TF01 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PNISRQ8TF01 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PNISRQ8TF01 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PNISRQ8TF01 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PNISRQ8TF01 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PNISRQ8TF01 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PNISRQ8TF01 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PNISRQ8TF01 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PNISRQ8TF01 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PNISRQ8TF01 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PNISRQ8TF01 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PNISRQ8TF01 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PNISRQ8TF01 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PNISRQ8TF01 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PNISRQ8TF01 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PNISRQ8TF01 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PNISRQ8TF01 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PNISRQ8TF01 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
PNISRQ8TF01 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PNISRQ8TF01 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PNISRQ8TF01 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PNISRQ8TF01 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PNISRQ8TF01 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PNISRQ8TF01 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PNISRQ8TF01 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PNISRQ8TF01 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PNISRQ8TF01 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PNISRQ8TF01 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PNISRQ8TF01 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PNISRQ8TF01 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PNISRQ8TF01 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms