Protein–RNA interactions for Protein: Q86TB3

ALPK2, Alpha-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK2Q86TB3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK2Q86TB3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALPK2Q86TB3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALPK2Q86TB3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALPK2Q86TB3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK2Q86TB3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK2Q86TB3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALPK2Q86TB3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALPK2Q86TB3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALPK2Q86TB3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALPK2Q86TB3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALPK2Q86TB3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK2Q86TB3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK2Q86TB3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK2Q86TB3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALPK2Q86TB3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALPK2Q86TB3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALPK2Q86TB3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALPK2Q86TB3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALPK2Q86TB3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALPK2Q86TB3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALPK2Q86TB3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK2Q86TB3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK2Q86TB3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALPK2Q86TB3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.56
ALPK2Q86TB3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALPK2Q86TB3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALPK2Q86TB3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALPK2Q86TB3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALPK2Q86TB3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALPK2Q86TB3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALPK2Q86TB3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALPK2Q86TB3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALPK2Q86TB3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK2Q86TB3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK2Q86TB3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK2Q86TB3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALPK2Q86TB3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK2Q86TB3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALPK2Q86TB3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK2Q86TB3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALPK2Q86TB3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK2Q86TB3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK2Q86TB3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALPK2Q86TB3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALPK2Q86TB3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALPK2Q86TB3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK2Q86TB3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALPK2Q86TB3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALPK2Q86TB3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK2Q86TB3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALPK2Q86TB3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK2Q86TB3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK2Q86TB3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK2Q86TB3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK2Q86TB3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALPK2Q86TB3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALPK2Q86TB3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALPK2Q86TB3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALPK2Q86TB3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALPK2Q86TB3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALPK2Q86TB3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK2Q86TB3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALPK2Q86TB3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK2Q86TB3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK2Q86TB3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK2Q86TB3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALPK2Q86TB3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALPK2Q86TB3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALPK2Q86TB3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ALPK2Q86TB3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALPK2Q86TB3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALPK2Q86TB3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms