Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIGD3Q6B0B8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIGD3Q6B0B8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIGD3Q6B0B8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIGD3Q6B0B8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TIGD3Q6B0B8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TIGD3Q6B0B8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TIGD3Q6B0B8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIGD3Q6B0B8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TIGD3Q6B0B8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TIGD3Q6B0B8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TIGD3Q6B0B8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TIGD3Q6B0B8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TIGD3Q6B0B8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TIGD3Q6B0B8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIGD3Q6B0B8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIGD3Q6B0B8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIGD3Q6B0B8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TIGD3Q6B0B8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TIGD3Q6B0B8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms