Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
HDGFL1Q5TGJ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HDGFL1Q5TGJ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HDGFL1Q5TGJ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HDGFL1Q5TGJ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HDGFL1Q5TGJ6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HDGFL1Q5TGJ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HDGFL1Q5TGJ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HDGFL1Q5TGJ6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HDGFL1Q5TGJ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
HDGFL1Q5TGJ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
HDGFL1Q5TGJ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
HDGFL1Q5TGJ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
HDGFL1Q5TGJ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
HDGFL1Q5TGJ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
HDGFL1Q5TGJ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
HDGFL1Q5TGJ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HDGFL1Q5TGJ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
HDGFL1Q5TGJ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
HDGFL1Q5TGJ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
HDGFL1Q5TGJ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
HDGFL1Q5TGJ6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
HDGFL1Q5TGJ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HDGFL1Q5TGJ6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HDGFL1Q5TGJ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HDGFL1Q5TGJ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
HDGFL1Q5TGJ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
HDGFL1Q5TGJ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
HDGFL1Q5TGJ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
HDGFL1Q5TGJ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
HDGFL1Q5TGJ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HDGFL1Q5TGJ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
HDGFL1Q5TGJ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
HDGFL1Q5TGJ6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HDGFL1Q5TGJ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HDGFL1Q5TGJ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HDGFL1Q5TGJ6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HDGFL1Q5TGJ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
HDGFL1Q5TGJ6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HDGFL1Q5TGJ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
HDGFL1Q5TGJ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
HDGFL1Q5TGJ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HDGFL1Q5TGJ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HDGFL1Q5TGJ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
HDGFL1Q5TGJ6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
HDGFL1Q5TGJ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
HDGFL1Q5TGJ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
HDGFL1Q5TGJ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
HDGFL1Q5TGJ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
HDGFL1Q5TGJ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HDGFL1Q5TGJ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HDGFL1Q5TGJ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
HDGFL1Q5TGJ6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
HDGFL1Q5TGJ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HDGFL1Q5TGJ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
HDGFL1Q5TGJ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HDGFL1Q5TGJ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
HDGFL1Q5TGJ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HDGFL1Q5TGJ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
HDGFL1Q5TGJ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
HDGFL1Q5TGJ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HDGFL1Q5TGJ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HDGFL1Q5TGJ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HDGFL1Q5TGJ6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HDGFL1Q5TGJ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HDGFL1Q5TGJ6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HDGFL1Q5TGJ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HDGFL1Q5TGJ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HDGFL1Q5TGJ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HDGFL1Q5TGJ6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
HDGFL1Q5TGJ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HDGFL1Q5TGJ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HDGFL1Q5TGJ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HDGFL1Q5TGJ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HDGFL1Q5TGJ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HDGFL1Q5TGJ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HDGFL1Q5TGJ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HDGFL1Q5TGJ6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HDGFL1Q5TGJ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HDGFL1Q5TGJ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HDGFL1Q5TGJ6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HDGFL1Q5TGJ6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HDGFL1Q5TGJ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
HDGFL1Q5TGJ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HDGFL1Q5TGJ6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HDGFL1Q5TGJ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HDGFL1Q5TGJ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HDGFL1Q5TGJ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HDGFL1Q5TGJ6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
HDGFL1Q5TGJ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
HDGFL1Q5TGJ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
HDGFL1Q5TGJ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HDGFL1Q5TGJ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HDGFL1Q5TGJ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HDGFL1Q5TGJ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
HDGFL1Q5TGJ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HDGFL1Q5TGJ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms