Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.29■■■■■ 4.68
HDGFL1Q5TGJ6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
HDGFL1Q5TGJ6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
HDGFL1Q5TGJ6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
HDGFL1Q5TGJ6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
HDGFL1Q5TGJ6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
HDGFL1Q5TGJ6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
HDGFL1Q5TGJ6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
HDGFL1Q5TGJ6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
HDGFL1Q5TGJ6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
HDGFL1Q5TGJ6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
HDGFL1Q5TGJ6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
HDGFL1Q5TGJ6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
HDGFL1Q5TGJ6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
HDGFL1Q5TGJ6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
HDGFL1Q5TGJ6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
HDGFL1Q5TGJ6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
HDGFL1Q5TGJ6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
HDGFL1Q5TGJ6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
HDGFL1Q5TGJ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
HDGFL1Q5TGJ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
HDGFL1Q5TGJ6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
HDGFL1Q5TGJ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
HDGFL1Q5TGJ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
HDGFL1Q5TGJ6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
HDGFL1Q5TGJ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
HDGFL1Q5TGJ6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
HDGFL1Q5TGJ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
HDGFL1Q5TGJ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
HDGFL1Q5TGJ6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
HDGFL1Q5TGJ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
HDGFL1Q5TGJ6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
HDGFL1Q5TGJ6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
HDGFL1Q5TGJ6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
HDGFL1Q5TGJ6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
HDGFL1Q5TGJ6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
HDGFL1Q5TGJ6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
HDGFL1Q5TGJ6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
HDGFL1Q5TGJ6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
HDGFL1Q5TGJ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
HDGFL1Q5TGJ6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
HDGFL1Q5TGJ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
HDGFL1Q5TGJ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
HDGFL1Q5TGJ6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
HDGFL1Q5TGJ6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
HDGFL1Q5TGJ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
HDGFL1Q5TGJ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
HDGFL1Q5TGJ6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
HDGFL1Q5TGJ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
HDGFL1Q5TGJ6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
HDGFL1Q5TGJ6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
HDGFL1Q5TGJ6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
HDGFL1Q5TGJ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
HDGFL1Q5TGJ6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
HDGFL1Q5TGJ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HDGFL1Q5TGJ6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
HDGFL1Q5TGJ6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
HDGFL1Q5TGJ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
HDGFL1Q5TGJ6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
HDGFL1Q5TGJ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
HDGFL1Q5TGJ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
HDGFL1Q5TGJ6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
HDGFL1Q5TGJ6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
HDGFL1Q5TGJ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
HDGFL1Q5TGJ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
HDGFL1Q5TGJ6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
HDGFL1Q5TGJ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
HDGFL1Q5TGJ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
HDGFL1Q5TGJ6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
HDGFL1Q5TGJ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
HDGFL1Q5TGJ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
HDGFL1Q5TGJ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HDGFL1Q5TGJ6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
HDGFL1Q5TGJ6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
HDGFL1Q5TGJ6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
HDGFL1Q5TGJ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HDGFL1Q5TGJ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
HDGFL1Q5TGJ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
HDGFL1Q5TGJ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HDGFL1Q5TGJ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
HDGFL1Q5TGJ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
HDGFL1Q5TGJ6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
HDGFL1Q5TGJ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HDGFL1Q5TGJ6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
HDGFL1Q5TGJ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
HDGFL1Q5TGJ6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
HDGFL1Q5TGJ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
HDGFL1Q5TGJ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
HDGFL1Q5TGJ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
HDGFL1Q5TGJ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
HDGFL1Q5TGJ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
HDGFL1Q5TGJ6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
HDGFL1Q5TGJ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms