Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COLEC12Q5KU26 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COLEC12Q5KU26 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
COLEC12Q5KU26 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COLEC12Q5KU26 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COLEC12Q5KU26 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COLEC12Q5KU26 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COLEC12Q5KU26 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COLEC12Q5KU26 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COLEC12Q5KU26 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COLEC12Q5KU26 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COLEC12Q5KU26 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COLEC12Q5KU26 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COLEC12Q5KU26 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COLEC12Q5KU26 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COLEC12Q5KU26 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COLEC12Q5KU26 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COLEC12Q5KU26 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COLEC12Q5KU26 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COLEC12Q5KU26 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COLEC12Q5KU26 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COLEC12Q5KU26 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COLEC12Q5KU26 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COLEC12Q5KU26 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COLEC12Q5KU26 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COLEC12Q5KU26 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COLEC12Q5KU26 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COLEC12Q5KU26 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COLEC12Q5KU26 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COLEC12Q5KU26 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COLEC12Q5KU26 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COLEC12Q5KU26 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COLEC12Q5KU26 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COLEC12Q5KU26 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COLEC12Q5KU26 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COLEC12Q5KU26 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COLEC12Q5KU26 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COLEC12Q5KU26 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COLEC12Q5KU26 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COLEC12Q5KU26 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COLEC12Q5KU26 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COLEC12Q5KU26 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COLEC12Q5KU26 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COLEC12Q5KU26 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COLEC12Q5KU26 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COLEC12Q5KU26 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COLEC12Q5KU26 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COLEC12Q5KU26 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COLEC12Q5KU26 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COLEC12Q5KU26 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COLEC12Q5KU26 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COLEC12Q5KU26 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COLEC12Q5KU26 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COLEC12Q5KU26 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COLEC12Q5KU26 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COLEC12Q5KU26 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COLEC12Q5KU26 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COLEC12Q5KU26 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COLEC12Q5KU26 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COLEC12Q5KU26 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
COLEC12Q5KU26 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COLEC12Q5KU26 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COLEC12Q5KU26 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COLEC12Q5KU26 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COLEC12Q5KU26 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COLEC12Q5KU26 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COLEC12Q5KU26 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COLEC12Q5KU26 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms