Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNT1Q5JUK3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNT1Q5JUK3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNT1Q5JUK3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNT1Q5JUK3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNT1Q5JUK3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNT1Q5JUK3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNT1Q5JUK3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNT1Q5JUK3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNT1Q5JUK3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNT1Q5JUK3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNT1Q5JUK3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNT1Q5JUK3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNT1Q5JUK3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNT1Q5JUK3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNT1Q5JUK3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNT1Q5JUK3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNT1Q5JUK3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNT1Q5JUK3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNT1Q5JUK3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNT1Q5JUK3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNT1Q5JUK3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNT1Q5JUK3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNT1Q5JUK3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNT1Q5JUK3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNT1Q5JUK3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNT1Q5JUK3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNT1Q5JUK3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNT1Q5JUK3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNT1Q5JUK3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNT1Q5JUK3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNT1Q5JUK3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNT1Q5JUK3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNT1Q5JUK3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNT1Q5JUK3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNT1Q5JUK3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNT1Q5JUK3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNT1Q5JUK3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNT1Q5JUK3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNT1Q5JUK3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNT1Q5JUK3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNT1Q5JUK3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNT1Q5JUK3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNT1Q5JUK3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNT1Q5JUK3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNT1Q5JUK3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNT1Q5JUK3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNT1Q5JUK3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNT1Q5JUK3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNT1Q5JUK3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNT1Q5JUK3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNT1Q5JUK3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNT1Q5JUK3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNT1Q5JUK3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNT1Q5JUK3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNT1Q5JUK3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNT1Q5JUK3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNT1Q5JUK3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNT1Q5JUK3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNT1Q5JUK3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNT1Q5JUK3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNT1Q5JUK3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNT1Q5JUK3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNT1Q5JUK3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNT1Q5JUK3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNT1Q5JUK3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNT1Q5JUK3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNT1Q5JUK3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNT1Q5JUK3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNT1Q5JUK3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNT1Q5JUK3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNT1Q5JUK3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNT1Q5JUK3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNT1Q5JUK3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNT1Q5JUK3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNT1Q5JUK3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNT1Q5JUK3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNT1Q5JUK3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNT1Q5JUK3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNT1Q5JUK3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNT1Q5JUK3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNT1Q5JUK3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNT1Q5JUK3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNT1Q5JUK3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNT1Q5JUK3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNT1Q5JUK3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNT1Q5JUK3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms