Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FREM1Q5H8C1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FREM1Q5H8C1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FREM1Q5H8C1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FREM1Q5H8C1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FREM1Q5H8C1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FREM1Q5H8C1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FREM1Q5H8C1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FREM1Q5H8C1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FREM1Q5H8C1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FREM1Q5H8C1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FREM1Q5H8C1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FREM1Q5H8C1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FREM1Q5H8C1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FREM1Q5H8C1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FREM1Q5H8C1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FREM1Q5H8C1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FREM1Q5H8C1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FREM1Q5H8C1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FREM1Q5H8C1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FREM1Q5H8C1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FREM1Q5H8C1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FREM1Q5H8C1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FREM1Q5H8C1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FREM1Q5H8C1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FREM1Q5H8C1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FREM1Q5H8C1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FREM1Q5H8C1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FREM1Q5H8C1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FREM1Q5H8C1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FREM1Q5H8C1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FREM1Q5H8C1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FREM1Q5H8C1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FREM1Q5H8C1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FREM1Q5H8C1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FREM1Q5H8C1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FREM1Q5H8C1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FREM1Q5H8C1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FREM1Q5H8C1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FREM1Q5H8C1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FREM1Q5H8C1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FREM1Q5H8C1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FREM1Q5H8C1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FREM1Q5H8C1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FREM1Q5H8C1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FREM1Q5H8C1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FREM1Q5H8C1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FREM1Q5H8C1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FREM1Q5H8C1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FREM1Q5H8C1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FREM1Q5H8C1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FREM1Q5H8C1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FREM1Q5H8C1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FREM1Q5H8C1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FREM1Q5H8C1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FREM1Q5H8C1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FREM1Q5H8C1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FREM1Q5H8C1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FREM1Q5H8C1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FREM1Q5H8C1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FREM1Q5H8C1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FREM1Q5H8C1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FREM1Q5H8C1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FREM1Q5H8C1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FREM1Q5H8C1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FREM1Q5H8C1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FREM1Q5H8C1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FREM1Q5H8C1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FREM1Q5H8C1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FREM1Q5H8C1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FREM1Q5H8C1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FREM1Q5H8C1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FREM1Q5H8C1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FREM1Q5H8C1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms