Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGAP29Q52LW3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGAP29Q52LW3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGAP29Q52LW3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGAP29Q52LW3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGAP29Q52LW3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGAP29Q52LW3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARHGAP29Q52LW3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGAP29Q52LW3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGAP29Q52LW3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGAP29Q52LW3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGAP29Q52LW3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGAP29Q52LW3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGAP29Q52LW3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGAP29Q52LW3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGAP29Q52LW3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGAP29Q52LW3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGAP29Q52LW3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGAP29Q52LW3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARHGAP29Q52LW3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARHGAP29Q52LW3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARHGAP29Q52LW3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARHGAP29Q52LW3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARHGAP29Q52LW3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARHGAP29Q52LW3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARHGAP29Q52LW3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARHGAP29Q52LW3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARHGAP29Q52LW3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARHGAP29Q52LW3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ARHGAP29Q52LW3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARHGAP29Q52LW3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARHGAP29Q52LW3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARHGAP29Q52LW3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGAP29Q52LW3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGAP29Q52LW3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGAP29Q52LW3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGAP29Q52LW3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGAP29Q52LW3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGAP29Q52LW3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGAP29Q52LW3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGAP29Q52LW3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARHGAP29Q52LW3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGAP29Q52LW3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGAP29Q52LW3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGAP29Q52LW3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARHGAP29Q52LW3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARHGAP29Q52LW3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGAP29Q52LW3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARHGAP29Q52LW3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARHGAP29Q52LW3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARHGAP29Q52LW3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARHGAP29Q52LW3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP29Q52LW3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARHGAP29Q52LW3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP29Q52LW3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARHGAP29Q52LW3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP29Q52LW3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARHGAP29Q52LW3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGAP29Q52LW3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARHGAP29Q52LW3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP29Q52LW3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP29Q52LW3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARHGAP29Q52LW3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARHGAP29Q52LW3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARHGAP29Q52LW3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ARHGAP29Q52LW3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARHGAP29Q52LW3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARHGAP29Q52LW3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARHGAP29Q52LW3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGAP29Q52LW3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARHGAP29Q52LW3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARHGAP29Q52LW3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGAP29Q52LW3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARHGAP29Q52LW3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGAP29Q52LW3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGAP29Q52LW3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGAP29Q52LW3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARHGAP29Q52LW3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARHGAP29Q52LW3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARHGAP29Q52LW3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGAP29Q52LW3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARHGAP29Q52LW3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGAP29Q52LW3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGAP29Q52LW3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGAP29Q52LW3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARHGAP29Q52LW3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGAP29Q52LW3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGAP29Q52LW3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARHGAP29Q52LW3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGAP29Q52LW3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGAP29Q52LW3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGAP29Q52LW3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGAP29Q52LW3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP29Q52LW3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGAP29Q52LW3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGAP29Q52LW3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP29Q52LW3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP29Q52LW3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms