Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC01620Q4KN68 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LINC01620Q4KN68 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC01620Q4KN68 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LINC01620Q4KN68 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC01620Q4KN68 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LINC01620Q4KN68 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC01620Q4KN68 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LINC01620Q4KN68 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC01620Q4KN68 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC01620Q4KN68 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC01620Q4KN68 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC01620Q4KN68 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01620Q4KN68 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01620Q4KN68 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01620Q4KN68 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01620Q4KN68 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01620Q4KN68 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01620Q4KN68 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01620Q4KN68 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01620Q4KN68 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01620Q4KN68 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01620Q4KN68 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01620Q4KN68 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01620Q4KN68 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01620Q4KN68 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01620Q4KN68 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01620Q4KN68 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01620Q4KN68 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01620Q4KN68 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01620Q4KN68 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01620Q4KN68 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01620Q4KN68 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01620Q4KN68 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms