Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP19-7Q3SYF9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP19-7Q3SYF9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP19-7Q3SYF9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP19-7Q3SYF9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP19-7Q3SYF9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP19-7Q3SYF9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms