Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP19-7Q3SYF9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
KRTAP19-7Q3SYF9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP19-7Q3SYF9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP19-7Q3SYF9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP19-7Q3SYF9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP19-7Q3SYF9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP19-7Q3SYF9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP19-7Q3SYF9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP19-7Q3SYF9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP19-7Q3SYF9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP19-7Q3SYF9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP19-7Q3SYF9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
KRTAP19-7Q3SYF9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KRTAP19-7Q3SYF9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP19-7Q3SYF9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP19-7Q3SYF9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP19-7Q3SYF9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP19-7Q3SYF9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP19-7Q3SYF9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP19-7Q3SYF9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP19-7Q3SYF9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP19-7Q3SYF9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP19-7Q3SYF9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP19-7Q3SYF9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP19-7Q3SYF9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP19-7Q3SYF9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP19-7Q3SYF9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP19-7Q3SYF9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP19-7Q3SYF9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP19-7Q3SYF9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP19-7Q3SYF9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP19-7Q3SYF9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP19-7Q3SYF9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP19-7Q3SYF9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP19-7Q3SYF9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP19-7Q3SYF9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP19-7Q3SYF9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP19-7Q3SYF9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP19-7Q3SYF9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP19-7Q3SYF9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP19-7Q3SYF9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP19-7Q3SYF9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP19-7Q3SYF9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP19-7Q3SYF9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KRTAP19-7Q3SYF9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP19-7Q3SYF9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP19-7Q3SYF9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP19-7Q3SYF9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP19-7Q3SYF9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP19-7Q3SYF9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP19-7Q3SYF9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP19-7Q3SYF9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP19-7Q3SYF9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP19-7Q3SYF9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP19-7Q3SYF9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP19-7Q3SYF9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP19-7Q3SYF9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP19-7Q3SYF9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
KRTAP19-7Q3SYF9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP19-7Q3SYF9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP19-7Q3SYF9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP19-7Q3SYF9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP19-7Q3SYF9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP19-7Q3SYF9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP19-7Q3SYF9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP19-7Q3SYF9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP19-7Q3SYF9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP19-7Q3SYF9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP19-7Q3SYF9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP19-7Q3SYF9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP19-7Q3SYF9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP19-7Q3SYF9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP19-7Q3SYF9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP19-7Q3SYF9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP19-7Q3SYF9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP19-7Q3SYF9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP19-7Q3SYF9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms