Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP19-7Q3SYF9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP19-7Q3SYF9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP19-7Q3SYF9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP19-7Q3SYF9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms