Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms