Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC18A3Q16572 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC18A3Q16572 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC18A3Q16572 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC18A3Q16572 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC18A3Q16572 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC18A3Q16572 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC18A3Q16572 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC18A3Q16572 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC18A3Q16572 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC18A3Q16572 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC18A3Q16572 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC18A3Q16572 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC18A3Q16572 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC18A3Q16572 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC18A3Q16572 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC18A3Q16572 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC18A3Q16572 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC18A3Q16572 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC18A3Q16572 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC18A3Q16572 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC18A3Q16572 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC18A3Q16572 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC18A3Q16572 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC18A3Q16572 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC18A3Q16572 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC18A3Q16572 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC18A3Q16572 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC18A3Q16572 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC18A3Q16572 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC18A3Q16572 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC18A3Q16572 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC18A3Q16572 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC18A3Q16572 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC18A3Q16572 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC18A3Q16572 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC18A3Q16572 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC18A3Q16572 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC18A3Q16572 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC18A3Q16572 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC18A3Q16572 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC18A3Q16572 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC18A3Q16572 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC18A3Q16572 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC18A3Q16572 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC18A3Q16572 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC18A3Q16572 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC18A3Q16572 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC18A3Q16572 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC18A3Q16572 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC18A3Q16572 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC18A3Q16572 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC18A3Q16572 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC18A3Q16572 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC18A3Q16572 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC18A3Q16572 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC18A3Q16572 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC18A3Q16572 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC18A3Q16572 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC18A3Q16572 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC18A3Q16572 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC18A3Q16572 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC18A3Q16572 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC18A3Q16572 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC18A3Q16572 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC18A3Q16572 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC18A3Q16572 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC18A3Q16572 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC18A3Q16572 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC18A3Q16572 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC18A3Q16572 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC18A3Q16572 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC18A3Q16572 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC18A3Q16572 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC18A3Q16572 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC18A3Q16572 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC18A3Q16572 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC18A3Q16572 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC18A3Q16572 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC18A3Q16572 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC18A3Q16572 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC18A3Q16572 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC18A3Q16572 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC18A3Q16572 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC18A3Q16572 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC18A3Q16572 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC18A3Q16572 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC18A3Q16572 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC18A3Q16572 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC18A3Q16572 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC18A3Q16572 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC18A3Q16572 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC18A3Q16572 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC18A3Q16572 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC18A3Q16572 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC18A3Q16572 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC18A3Q16572 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC18A3Q16572 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC18A3Q16572 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC18A3Q16572 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
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