Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP1Q15431 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYCP1Q15431 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYCP1Q15431 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SYCP1Q15431 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYCP1Q15431 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYCP1Q15431 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SYCP1Q15431 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
SYCP1Q15431 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYCP1Q15431 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYCP1Q15431 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SYCP1Q15431 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYCP1Q15431 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCP1Q15431 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP1Q15431 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP1Q15431 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP1Q15431 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP1Q15431 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP1Q15431 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYCP1Q15431 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYCP1Q15431 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYCP1Q15431 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP1Q15431 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SYCP1Q15431 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYCP1Q15431 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYCP1Q15431 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYCP1Q15431 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP1Q15431 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP1Q15431 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYCP1Q15431 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYCP1Q15431 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYCP1Q15431 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYCP1Q15431 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYCP1Q15431 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYCP1Q15431 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYCP1Q15431 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYCP1Q15431 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYCP1Q15431 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYCP1Q15431 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYCP1Q15431 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYCP1Q15431 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SYCP1Q15431 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYCP1Q15431 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYCP1Q15431 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYCP1Q15431 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYCP1Q15431 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYCP1Q15431 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYCP1Q15431 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP1Q15431 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYCP1Q15431 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP1Q15431 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCP1Q15431 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYCP1Q15431 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYCP1Q15431 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP1Q15431 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP1Q15431 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP1Q15431 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYCP1Q15431 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
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