Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKD1Q15139 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKD1Q15139 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKD1Q15139 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKD1Q15139 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRKD1Q15139 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKD1Q15139 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKD1Q15139 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKD1Q15139 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKD1Q15139 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKD1Q15139 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKD1Q15139 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKD1Q15139 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKD1Q15139 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKD1Q15139 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKD1Q15139 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKD1Q15139 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKD1Q15139 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKD1Q15139 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKD1Q15139 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKD1Q15139 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKD1Q15139 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKD1Q15139 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKD1Q15139 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKD1Q15139 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRKD1Q15139 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKD1Q15139 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKD1Q15139 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKD1Q15139 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKD1Q15139 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKD1Q15139 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKD1Q15139 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKD1Q15139 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKD1Q15139 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKD1Q15139 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKD1Q15139 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKD1Q15139 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKD1Q15139 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKD1Q15139 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKD1Q15139 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKD1Q15139 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKD1Q15139 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKD1Q15139 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKD1Q15139 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRKD1Q15139 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKD1Q15139 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKD1Q15139 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKD1Q15139 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKD1Q15139 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKD1Q15139 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKD1Q15139 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKD1Q15139 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKD1Q15139 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKD1Q15139 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKD1Q15139 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKD1Q15139 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKD1Q15139 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKD1Q15139 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKD1Q15139 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKD1Q15139 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKD1Q15139 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKD1Q15139 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKD1Q15139 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKD1Q15139 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKD1Q15139 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKD1Q15139 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKD1Q15139 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKD1Q15139 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKD1Q15139 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKD1Q15139 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKD1Q15139 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKD1Q15139 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKD1Q15139 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKD1Q15139 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKD1Q15139 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKD1Q15139 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKD1Q15139 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKD1Q15139 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKD1Q15139 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKD1Q15139 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKD1Q15139 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKD1Q15139 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRKD1Q15139 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKD1Q15139 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKD1Q15139 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
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