Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFTN1Q14699 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RFTN1Q14699 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RFTN1Q14699 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RFTN1Q14699 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RFTN1Q14699 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFTN1Q14699 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RFTN1Q14699 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RFTN1Q14699 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RFTN1Q14699 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RFTN1Q14699 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RFTN1Q14699 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RFTN1Q14699 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RFTN1Q14699 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFTN1Q14699 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RFTN1Q14699 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RFTN1Q14699 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RFTN1Q14699 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RFTN1Q14699 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RFTN1Q14699 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RFTN1Q14699 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RFTN1Q14699 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RFTN1Q14699 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RFTN1Q14699 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RFTN1Q14699 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFTN1Q14699 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RFTN1Q14699 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RFTN1Q14699 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RFTN1Q14699 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RFTN1Q14699 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RFTN1Q14699 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RFTN1Q14699 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RFTN1Q14699 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFTN1Q14699 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RFTN1Q14699 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RFTN1Q14699 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFTN1Q14699 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RFTN1Q14699 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RFTN1Q14699 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RFTN1Q14699 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RFTN1Q14699 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RFTN1Q14699 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFTN1Q14699 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RFTN1Q14699 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFTN1Q14699 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFTN1Q14699 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RFTN1Q14699 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFTN1Q14699 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RFTN1Q14699 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RFTN1Q14699 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RFTN1Q14699 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFTN1Q14699 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFTN1Q14699 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RFTN1Q14699 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFTN1Q14699 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFTN1Q14699 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFTN1Q14699 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFTN1Q14699 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RFTN1Q14699 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFTN1Q14699 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFTN1Q14699 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RFTN1Q14699 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RFTN1Q14699 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFTN1Q14699 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFTN1Q14699 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RFTN1Q14699 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RFTN1Q14699 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RFTN1Q14699 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFTN1Q14699 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFTN1Q14699 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFTN1Q14699 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFTN1Q14699 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFTN1Q14699 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFTN1Q14699 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RFTN1Q14699 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFTN1Q14699 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFTN1Q14699 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFTN1Q14699 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFTN1Q14699 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFTN1Q14699 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFTN1Q14699 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RFTN1Q14699 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFTN1Q14699 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RFTN1Q14699 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFTN1Q14699 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFTN1Q14699 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFTN1Q14699 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFTN1Q14699 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFTN1Q14699 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFTN1Q14699 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFTN1Q14699 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFTN1Q14699 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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