Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ALCAMQ13740 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ALCAMQ13740 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ALCAMQ13740 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ALCAMQ13740 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ALCAMQ13740 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ALCAMQ13740 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ALCAMQ13740 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ALCAMQ13740 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ALCAMQ13740 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ALCAMQ13740 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ALCAMQ13740 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALCAMQ13740 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALCAMQ13740 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALCAMQ13740 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ALCAMQ13740 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ALCAMQ13740 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ALCAMQ13740 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ALCAMQ13740 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALCAMQ13740 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALCAMQ13740 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALCAMQ13740 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ALCAMQ13740 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ALCAMQ13740 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ALCAMQ13740 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ALCAMQ13740 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ALCAMQ13740 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ALCAMQ13740 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALCAMQ13740 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALCAMQ13740 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ALCAMQ13740 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ALCAMQ13740 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ALCAMQ13740 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ALCAMQ13740 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ALCAMQ13740 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ALCAMQ13740 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ALCAMQ13740 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ALCAMQ13740 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALCAMQ13740 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALCAMQ13740 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ALCAMQ13740 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ALCAMQ13740 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALCAMQ13740 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ALCAMQ13740 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ALCAMQ13740 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ALCAMQ13740 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALCAMQ13740 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ALCAMQ13740 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALCAMQ13740 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALCAMQ13740 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ALCAMQ13740 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ALCAMQ13740 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ALCAMQ13740 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ALCAMQ13740 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ALCAMQ13740 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALCAMQ13740 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ALCAMQ13740 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ALCAMQ13740 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALCAMQ13740 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ALCAMQ13740 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALCAMQ13740 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALCAMQ13740 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ALCAMQ13740 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALCAMQ13740 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ALCAMQ13740 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ALCAMQ13740 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ALCAMQ13740 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ALCAMQ13740 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALCAMQ13740 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ALCAMQ13740 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALCAMQ13740 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALCAMQ13740 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ALCAMQ13740 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ALCAMQ13740 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ALCAMQ13740 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALCAMQ13740 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALCAMQ13740 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALCAMQ13740 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALCAMQ13740 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALCAMQ13740 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ALCAMQ13740 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ALCAMQ13740 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ALCAMQ13740 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALCAMQ13740 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALCAMQ13740 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ALCAMQ13740 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ALCAMQ13740 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
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