Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PEX6Q13608 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PEX6Q13608 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PEX6Q13608 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PEX6Q13608 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PEX6Q13608 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PEX6Q13608 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PEX6Q13608 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PEX6Q13608 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PEX6Q13608 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PEX6Q13608 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PEX6Q13608 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PEX6Q13608 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PEX6Q13608 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PEX6Q13608 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PEX6Q13608 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PEX6Q13608 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PEX6Q13608 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PEX6Q13608 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PEX6Q13608 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PEX6Q13608 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PEX6Q13608 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PEX6Q13608 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PEX6Q13608 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PEX6Q13608 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PEX6Q13608 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PEX6Q13608 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PEX6Q13608 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PEX6Q13608 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PEX6Q13608 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PEX6Q13608 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PEX6Q13608 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PEX6Q13608 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PEX6Q13608 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PEX6Q13608 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PEX6Q13608 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PEX6Q13608 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PEX6Q13608 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PEX6Q13608 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PEX6Q13608 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PEX6Q13608 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PEX6Q13608 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PEX6Q13608 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PEX6Q13608 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PEX6Q13608 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PEX6Q13608 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PEX6Q13608 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PEX6Q13608 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PEX6Q13608 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PEX6Q13608 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PEX6Q13608 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PEX6Q13608 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PEX6Q13608 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PEX6Q13608 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX6Q13608 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX6Q13608 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX6Q13608 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PEX6Q13608 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PEX6Q13608 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PEX6Q13608 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PEX6Q13608 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PEX6Q13608 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PEX6Q13608 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX6Q13608 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PEX6Q13608 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PEX6Q13608 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX6Q13608 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX6Q13608 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PEX6Q13608 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PEX6Q13608 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PEX6Q13608 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PEX6Q13608 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PEX6Q13608 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PEX6Q13608 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
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PEX6Q13608 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PEX6Q13608 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PEX6Q13608 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PEX6Q13608 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PEX6Q13608 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PEX6Q13608 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PEX6Q13608 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX6Q13608 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX6Q13608 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX6Q13608 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX6Q13608 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX6Q13608 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PEX6Q13608 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PEX6Q13608 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PEX6Q13608 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PEX6Q13608 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PEX6Q13608 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PEX6Q13608 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PEX6Q13608 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PEX6Q13608 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PEX6Q13608 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PEX6Q13608 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PEX6Q13608 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PEX6Q13608 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PEX6Q13608 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
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