Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4EBP1Q13541 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF4EBP1Q13541 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF4EBP1Q13541 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4EBP1Q13541 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4EBP1Q13541 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF4EBP1Q13541 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4EBP1Q13541 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF4EBP1Q13541 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4EBP1Q13541 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4EBP1Q13541 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4EBP1Q13541 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF4EBP1Q13541 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4EBP1Q13541 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4EBP1Q13541 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF4EBP1Q13541 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4EBP1Q13541 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF4EBP1Q13541 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF4EBP1Q13541 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4EBP1Q13541 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIF4EBP1Q13541 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIF4EBP1Q13541 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4EBP1Q13541 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIF4EBP1Q13541 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4EBP1Q13541 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4EBP1Q13541 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4EBP1Q13541 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EIF4EBP1Q13541 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4EBP1Q13541 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF4EBP1Q13541 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4EBP1Q13541 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4EBP1Q13541 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF4EBP1Q13541 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4EBP1Q13541 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4EBP1Q13541 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF4EBP1Q13541 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF4EBP1Q13541 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4EBP1Q13541 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4EBP1Q13541 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4EBP1Q13541 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4EBP1Q13541 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4EBP1Q13541 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4EBP1Q13541 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4EBP1Q13541 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF4EBP1Q13541 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4EBP1Q13541 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4EBP1Q13541 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF4EBP1Q13541 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4EBP1Q13541 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF4EBP1Q13541 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4EBP1Q13541 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4EBP1Q13541 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4EBP1Q13541 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4EBP1Q13541 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4EBP1Q13541 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4EBP1Q13541 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4EBP1Q13541 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4EBP1Q13541 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4EBP1Q13541 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4EBP1Q13541 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4EBP1Q13541 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4EBP1Q13541 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4EBP1Q13541 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4EBP1Q13541 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4EBP1Q13541 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4EBP1Q13541 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4EBP1Q13541 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4EBP1Q13541 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF4EBP1Q13541 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4EBP1Q13541 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4EBP1Q13541 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4EBP1Q13541 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4EBP1Q13541 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4EBP1Q13541 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4EBP1Q13541 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4EBP1Q13541 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4EBP1Q13541 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4EBP1Q13541 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4EBP1Q13541 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4EBP1Q13541 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4EBP1Q13541 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4EBP1Q13541 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4EBP1Q13541 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4EBP1Q13541 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4EBP1Q13541 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4EBP1Q13541 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4EBP1Q13541 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4EBP1Q13541 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4EBP1Q13541 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4EBP1Q13541 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4EBP1Q13541 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4EBP1Q13541 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4EBP1Q13541 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF4EBP1Q13541 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4EBP1Q13541 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4EBP1Q13541 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4EBP1Q13541 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4EBP1Q13541 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4EBP1Q13541 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4EBP1Q13541 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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