Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PDE4DQ08499 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDE4DQ08499 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PDE4DQ08499 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDE4DQ08499 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDE4DQ08499 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PDE4DQ08499 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PDE4DQ08499 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PDE4DQ08499 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PDE4DQ08499 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PDE4DQ08499 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PDE4DQ08499 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PDE4DQ08499 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDE4DQ08499 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PDE4DQ08499 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PDE4DQ08499 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PDE4DQ08499 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PDE4DQ08499 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PDE4DQ08499 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PDE4DQ08499 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PDE4DQ08499 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PDE4DQ08499 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PDE4DQ08499 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PDE4DQ08499 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PDE4DQ08499 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDE4DQ08499 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDE4DQ08499 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDE4DQ08499 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDE4DQ08499 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PDE4DQ08499 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PDE4DQ08499 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PDE4DQ08499 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PDE4DQ08499 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PDE4DQ08499 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PDE4DQ08499 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PDE4DQ08499 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PDE4DQ08499 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
PDE4DQ08499 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE4DQ08499 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE4DQ08499 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PDE4DQ08499 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PDE4DQ08499 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PDE4DQ08499 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PDE4DQ08499 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PDE4DQ08499 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PDE4DQ08499 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE4DQ08499 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE4DQ08499 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PDE4DQ08499 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PDE4DQ08499 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PDE4DQ08499 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PDE4DQ08499 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDE4DQ08499 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDE4DQ08499 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PDE4DQ08499 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PDE4DQ08499 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PDE4DQ08499 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE4DQ08499 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PDE4DQ08499 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDE4DQ08499 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PDE4DQ08499 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDE4DQ08499 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDE4DQ08499 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PDE4DQ08499 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE4DQ08499 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE4DQ08499 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PDE4DQ08499 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PDE4DQ08499 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDE4DQ08499 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PDE4DQ08499 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PDE4DQ08499 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PDE4DQ08499 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
PDE4DQ08499 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE4DQ08499 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE4DQ08499 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PDE4DQ08499 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDE4DQ08499 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDE4DQ08499 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.61
PDE4DQ08499 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDE4DQ08499 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE4DQ08499 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE4DQ08499 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE4DQ08499 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE4DQ08499 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE4DQ08499 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PDE4DQ08499 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.7 ms