Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPARDQ03181 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPARDQ03181 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARDQ03181 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARDQ03181 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARDQ03181 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPARDQ03181 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARDQ03181 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPARDQ03181 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPARDQ03181 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPARDQ03181 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPARDQ03181 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPARDQ03181 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPARDQ03181 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPARDQ03181 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPARDQ03181 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PPARDQ03181 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPARDQ03181 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPARDQ03181 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPARDQ03181 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPARDQ03181 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARDQ03181 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARDQ03181 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARDQ03181 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPARDQ03181 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARDQ03181 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPARDQ03181 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPARDQ03181 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARDQ03181 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARDQ03181 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPARDQ03181 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARDQ03181 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPARDQ03181 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARDQ03181 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPARDQ03181 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPARDQ03181 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPARDQ03181 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPARDQ03181 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPARDQ03181 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPARDQ03181 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPARDQ03181 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPARDQ03181 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPARDQ03181 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPARDQ03181 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPARDQ03181 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPARDQ03181 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPARDQ03181 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPARDQ03181 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPARDQ03181 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPARDQ03181 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARDQ03181 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARDQ03181 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARDQ03181 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPARDQ03181 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARDQ03181 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARDQ03181 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPARDQ03181 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPARDQ03181 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPARDQ03181 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPARDQ03181 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPARDQ03181 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPARDQ03181 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPARDQ03181 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPARDQ03181 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPARDQ03181 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARDQ03181 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARDQ03181 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARDQ03181 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARDQ03181 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPARDQ03181 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARDQ03181 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPARDQ03181 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPARDQ03181 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPARDQ03181 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPARDQ03181 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARDQ03181 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARDQ03181 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARDQ03181 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARDQ03181 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARDQ03181 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARDQ03181 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARDQ03181 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARDQ03181 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARDQ03181 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARDQ03181 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms