Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFNB1P98172 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFNB1P98172 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFNB1P98172 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFNB1P98172 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFNB1P98172 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFNB1P98172 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFNB1P98172 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFNB1P98172 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFNB1P98172 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFNB1P98172 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFNB1P98172 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFNB1P98172 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFNB1P98172 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFNB1P98172 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFNB1P98172 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EFNB1P98172 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFNB1P98172 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFNB1P98172 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFNB1P98172 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFNB1P98172 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNB1P98172 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNB1P98172 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNB1P98172 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFNB1P98172 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFNB1P98172 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFNB1P98172 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EFNB1P98172 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFNB1P98172 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFNB1P98172 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFNB1P98172 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFNB1P98172 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EFNB1P98172 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFNB1P98172 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNB1P98172 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNB1P98172 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNB1P98172 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFNB1P98172 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFNB1P98172 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFNB1P98172 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EFNB1P98172 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFNB1P98172 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFNB1P98172 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFNB1P98172 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFNB1P98172 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFNB1P98172 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFNB1P98172 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFNB1P98172 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFNB1P98172 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFNB1P98172 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFNB1P98172 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFNB1P98172 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNB1P98172 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNB1P98172 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNB1P98172 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EFNB1P98172 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFNB1P98172 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFNB1P98172 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFNB1P98172 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFNB1P98172 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFNB1P98172 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFNB1P98172 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFNB1P98172 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFNB1P98172 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFNB1P98172 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFNB1P98172 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFNB1P98172 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFNB1P98172 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFNB1P98172 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFNB1P98172 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EFNB1P98172 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFNB1P98172 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFNB1P98172 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFNB1P98172 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFNB1P98172 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNB1P98172 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNB1P98172 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNB1P98172 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFNB1P98172 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFNB1P98172 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFNB1P98172 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFNB1P98172 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFNB1P98172 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFNB1P98172 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EFNB1P98172 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFNB1P98172 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFNB1P98172 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFNB1P98172 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFNB1P98172 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFNB1P98172 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFNB1P98172 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFNB1P98172 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFNB1P98172 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFNB1P98172 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFNB1P98172 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFNB1P98172 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFNB1P98172 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFNB1P98172 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFNB1P98172 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFNB1P98172 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms