Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3F3AP84243 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3F3AP84243 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3F3AP84243 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3F3AP84243 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3F3AP84243 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3F3AP84243 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3F3AP84243 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3F3AP84243 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3F3AP84243 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3F3AP84243 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3F3AP84243 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3F3AP84243 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3F3AP84243 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3F3AP84243 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3F3AP84243 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3F3AP84243 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3F3AP84243 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3F3AP84243 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3F3AP84243 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3F3AP84243 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3F3AP84243 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3F3AP84243 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3F3AP84243 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3F3AP84243 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3F3AP84243 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3F3AP84243 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3F3AP84243 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
H3F3AP84243 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3F3AP84243 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3F3AP84243 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3F3AP84243 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3F3AP84243 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
H3F3AP84243 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H3F3AP84243 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3F3AP84243 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3F3AP84243 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3F3AP84243 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3F3AP84243 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3F3AP84243 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3F3AP84243 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3F3AP84243 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3F3AP84243 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3F3AP84243 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H3F3AP84243 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3F3AP84243 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3F3AP84243 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3F3AP84243 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3F3AP84243 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
H3F3AP84243 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3F3AP84243 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3F3AP84243 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3F3AP84243 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms