Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA52P62987 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBA52P62987 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA52P62987 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBA52P62987 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA52P62987 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA52P62987 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBA52P62987 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBA52P62987 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBA52P62987 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA52P62987 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA52P62987 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA52P62987 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA52P62987 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA52P62987 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA52P62987 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA52P62987 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA52P62987 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA52P62987 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA52P62987 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA52P62987 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA52P62987 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBA52P62987 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA52P62987 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBA52P62987 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBA52P62987 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA52P62987 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA52P62987 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBA52P62987 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA52P62987 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA52P62987 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA52P62987 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA52P62987 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA52P62987 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA52P62987 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA52P62987 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA52P62987 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBA52P62987 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBA52P62987 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBA52P62987 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBA52P62987 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBA52P62987 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBA52P62987 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBA52P62987 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBA52P62987 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBA52P62987 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBA52P62987 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBA52P62987 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBA52P62987 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBA52P62987 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBA52P62987 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA52P62987 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA52P62987 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA52P62987 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA52P62987 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA52P62987 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA52P62987 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA52P62987 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBA52P62987 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBA52P62987 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA52P62987 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA52P62987 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBA52P62987 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA52P62987 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA52P62987 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBA52P62987 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBA52P62987 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA52P62987 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA52P62987 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA52P62987 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA52P62987 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA52P62987 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA52P62987 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA52P62987 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA52P62987 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA52P62987 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA52P62987 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA52P62987 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA52P62987 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA52P62987 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA52P62987 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA52P62987 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA52P62987 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA52P62987 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA52P62987 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA52P62987 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA52P62987 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA52P62987 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA52P62987 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA52P62987 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA52P62987 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA52P62987 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA52P62987 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA52P62987 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA52P62987 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA52P62987 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA52P62987 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA52P62987 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA52P62987 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA52P62987 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms