Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00205P59089 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00205P59089 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00205P59089 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00205P59089 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00205P59089 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00205P59089 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00205P59089 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00205P59089 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00205P59089 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00205P59089 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00205P59089 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00205P59089 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC00205P59089 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00205P59089 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00205P59089 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00205P59089 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC00205P59089 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00205P59089 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00205P59089 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00205P59089 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00205P59089 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00205P59089 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00205P59089 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00205P59089 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00205P59089 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00205P59089 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00205P59089 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00205P59089 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00205P59089 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00205P59089 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00205P59089 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00205P59089 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00205P59089 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00205P59089 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00205P59089 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00205P59089 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00205P59089 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00205P59089 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00205P59089 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00205P59089 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00205P59089 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00205P59089 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00205P59089 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00205P59089 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00205P59089 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00205P59089 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00205P59089 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00205P59089 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00205P59089 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00205P59089 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00205P59089 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00205P59089 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00205P59089 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00205P59089 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00205P59089 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00205P59089 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00205P59089 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00205P59089 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00205P59089 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00205P59089 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00205P59089 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00205P59089 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00205P59089 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00205P59089 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00205P59089 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00205P59089 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00205P59089 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00205P59089 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00205P59089 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00205P59089 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00205P59089 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINC00205P59089 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00205P59089 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00205P59089 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00205P59089 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00205P59089 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00205P59089 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00205P59089 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00205P59089 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00205P59089 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00205P59089 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00205P59089 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00205P59089 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00205P59089 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms